Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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USP53Q70EK8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP53Q70EK8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP53Q70EK8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP53Q70EK8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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