Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms