Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP27Q6ZUM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms