Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL17Q6UXB2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL17Q6UXB2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms