Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf89Q6UX73 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf89Q6UX73 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms