Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A10Q6U841 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms