Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCD3Q6STE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms