Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RWDD4Q6NW29 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RWDD4Q6NW29 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms