Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECM29Q5VYK3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms