Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA1Q5VX52 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms