Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPRD2Q5VT52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPRD2Q5VT52 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms