Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms