Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D1BQ5T0F9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms