Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF2Q5BJF6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms