Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3KQ59H18 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3KQ59H18 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms