Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAB6CQ53S08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms