Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms