Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO43Q4G163 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms