Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
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