Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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RPE65Q16518 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPE65Q16518 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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RPE65Q16518 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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