Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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VAMP3Q15836 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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