Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRKQ15262 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms