Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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