Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD6Q15008 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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