Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSPNQ14714 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms