Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD11Q14690 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD11Q14690 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms