Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IHHQ14623 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IHHQ14623 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IHHQ14623 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms