Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3AQ14563 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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