Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA9Q13797 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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ITGA9Q13797 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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ITGA9Q13797 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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