Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX3Q13761 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms