Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAMK2BQ13554 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2BQ13554 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms