Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EIF4EBP1Q13541 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms