Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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