Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGCGQ13326 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGCGQ13326 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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