Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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BNIP1Q12981 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BNIP1Q12981 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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