Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN2AQ12879 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms