Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHD3Q12873 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHD3Q12873 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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