Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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