Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 ISD11YER048W-A 285 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 HUR1YGL168W 333 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YPR153WYPR153W 423 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 GPG1YGL121C 381 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 UBX4YMR067C 1251 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YLL007CYLL007C 1998 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YDL073WYDL073W 2955 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 NHP2YDL208W 471 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YDR521WYDR521W 336 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YFL012WYFL012W 447 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 SNU56YDR240C 1479 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP36Q12481 YJR003CYJR003C 1560 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 BIG1YHR101C 1008 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 URM1YIL008W 300 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 PAC1YOR269W 1485 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YDR029WYDR029W 315 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 RPL9AYGL147C 576 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 CMC4YMR194C-B 222 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 PAN2YGL094C 3348 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 SWF1YDR126W 1011 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YOR282WYOR282W 321 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YKL202WYKL202W 582 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 RPS30BYOR182C 192 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 RPB10YOR210W 213 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 ECM12YHR021W-A 456 nt0.67□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YKL123WYKL123W 381 nt0.67□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 RKR1YMR247C 4689 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 PKH2YOL100W 3246 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 GEA2YEL022W 4380 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP36Q12481 YER135CYER135C 393 nt0.65□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 OST1YJL002C 1431 nt0.64□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 INA22YIR024C 651 nt0.64□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.64□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YCR001WYCR001W 315 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 TIM13YGR181W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YJL135WYJL135W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 RPL38YLR325C 237 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YGR042WYGR042W 816 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 GPI15YNL038W 690 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 LTE1YAL024C 4308 nt0.61□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 LOA1YPR139C 903 nt0.61□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YML002WYML002W 2214 nt0.61□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 EAF6YJR082C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 CUL3YGR003W 2235 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YHL042WYHL042W 453 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 RPL26AYLR344W 384 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 PBI2YNL015W 228 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YPL261CYPL261C 309 nt0.59□□□□□ -2.31
RRP36Q12481 YIR044CYIR044C 186 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 YOL160WYOL160W 342 nt0.58□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.57□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 YLR269CYLR269C 351 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 CDC33YOL139C 642 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 BFR2YDR299W 1605 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 NPR2YEL062W 1848 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 PMP1YCR024C-A 123 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 UTP20YBL004W 7482 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP36Q12481 YHR125WYHR125W 306 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YOR218CYOR218C 420 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YPL044CYPL044C 549 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 RAD34YDR314C 2079 nt0.52□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 RPF1YHR088W 888 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YML108WYML108W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YDL011CYDL011C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 NFU1YKL040C 771 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 YBL071CYBL071C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP36Q12481 snR51snR51 107 nt0.5□□□□□ -2.33
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