Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms