Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4DQ08499 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms