Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms