Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN1Q05586 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms