Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 RPL9AYGL147C 576 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 URM1YIL008W 300 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 INA22YIR024C 651 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 PRP21YJL203W 843 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 DCP1YOL149W 696 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.34□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YMR160WYMR160W 2451 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 PRP16YKR086W 3216 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 ZIP2YGL249W 2115 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 PAC1YOR269W 1485 nt0.33□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 OST1YJL002C 1431 nt0.32□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YGL239CYGL239C 315 nt0.32□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YJR003CYJR003C 1560 nt0.32□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 EFR3YMR212C 2349 nt0.31□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 SPO11YHL022C 1197 nt0.31□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.31□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 GRX5YPL059W 453 nt0.31□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YGR042WYGR042W 816 nt0.3□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 RPL26AYLR344W 384 nt0.3□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YOR218CYOR218C 420 nt0.3□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 IRC16YPR038W 360 nt0.3□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.29□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 PHS1YJL097W 654 nt0.29□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 RPS27AYKL156W 249 nt0.29□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 GEA2YEL022W 4380 nt0.29□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 BFR2YDR299W 1605 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YHL042WYHL042W 453 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YKL044WYKL044W 321 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 YOR029WYOR029W 336 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 SVS1YPL163C 783 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 LOA1YPR139C 903 nt0.28□□□□□ -2.36
AVO2Q04749 PKH2YOL100W 3246 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 PMP1YCR024C-A 123 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 PRE4YFR050C 801 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 BER1YLR412W 825 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 UTP20YBL004W 7482 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 NPR2YEL062W 1848 nt0.27□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YDL016CYDL016C 303 nt0.26□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.26□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 CHS6YJL099W 2241 nt0.26□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 NOP9YJL010C 2001 nt0.25□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.25□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YJL135WYJL135W 318 nt0.25□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 snR13snR13 124 nt0.25□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YPL182CYPL182C 384 nt0.25□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 Q0255Q0255 1419 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 MLP1YKR095W 5628 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YDR029WYDR029W 315 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 HUR1YGL168W 333 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YGR025WYGR025W 303 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YKL202WYKL202W 582 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YNL050CYNL050C 813 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 RPB10YOR210W 213 nt0.24□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 CDC33YOL139C 642 nt0.23□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 TSC3YBR058C-A 243 nt0.23□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.22□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 RPS24BYIL069C 408 nt0.22□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YPL044CYPL044C 549 nt0.22□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 YPL261CYPL261C 309 nt0.22□□□□□ -2.37
AVO2Q04749 MLP2YIL149C 5040 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YDR344CYDR344C 444 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YER135CYER135C 393 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 RPL26BYGR034W 384 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YIR044CYIR044C 186 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YOL160WYOL160W 342 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 ULP2YIL031W 3105 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 CUL3YGR003W 2235 nt0.21□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YCK3YER123W 1575 nt0.2□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YJR141WYJR141W 1044 nt0.2□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YSP1YHR155W 3687 nt0.2□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 BIR1YJR089W 2865 nt0.2□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 UBC7YMR022W 498 nt0.19□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 ABF2YMR072W 552 nt0.19□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 SBH1YER087C-B 249 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 TIM13YGR181W 318 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YPL185WYPL185W 396 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 RAD34YDR314C 2079 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 BEM3YPL115C 3387 nt0.18□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 BSC3YLR465C 309 nt0.17□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 PBI2YNL015W 228 nt0.17□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 PET111YMR257C 2403 nt0.17□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 STE5YDR103W 2754 nt0.17□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 IQG1YPL242C 4488 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 BIG1YHR101C 1008 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 AI1Q0050 2505 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 SNU56YDR240C 1479 nt0.16□□□□□ -2.38
AVO2Q04749 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.7 ms