Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms