Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 PET111YMR257C 2403 nt0.04□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YGL015CYGL015C 393 nt0.03□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.03□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YLR271WYLR271W 825 nt0.03□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 YPR096CYPR096C 303 nt0.02□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 STE5YDR103W 2754 nt0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 MLP1YKR095W 5628 nt0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 YGR290WYGR290W 444 nt0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 BSC3YLR465C 309 nt0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 IQG1YPL242C 4488 nt0□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 FYV10YIL097W 1551 nt0□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 MLP2YIL149C 5040 nt0□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 YJR079WYJR079W 330 nt0□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 VIK1YPL253C 1944 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 BIG1YHR101C 1008 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 SDS22YKL193C 1017 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 COX12YLR038C 252 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 CDC33YOL139C 642 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 VAM3YOR106W 852 nt-0.01□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.02□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 CWC23YGL128C 852 nt-0.02□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 STF2YGR008C 255 nt-0.03□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 VMA21YGR105W 234 nt-0.03□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 YOR248WYOR248W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
PKR1Q03880 YPL044CYPL044C 549 nt-0.04□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 snR5snR5 204 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 WIP1YDR374W-A 270 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YGR228WYGR228W 345 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 RCN2YOR220W 798 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.05□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 PKH2YOL100W 3246 nt-0.06□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YDR269CYDR269C 324 nt-0.06□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.06□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YOR053WYOR053W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 PRP5YBR237W 2550 nt-0.06□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 snR13snR13 124 nt-0.07□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 SEC8YPR055W 3198 nt-0.08□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 SPO13YHR014W 876 nt-0.08□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YJL135WYJL135W 318 nt-0.08□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 snR190snR190 190 nt-0.09□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 INP2YMR163C 2118 nt-0.1□□□□□ -2.42
PKR1Q03880 YGR115CYGR115C 780 nt-0.11□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 POP7YBR167C 423 nt-0.11□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YNL050CYNL050C 813 nt-0.12□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 IRC16YPR038W 360 nt-0.12□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.13□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 HUG1YML058W-A 207 nt-0.13□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 MCM10YIL150C 1716 nt-0.13□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 SSS1YDR086C 243 nt-0.14□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 PHS1YJL097W 654 nt-0.14□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 MRPL50YNR022C 420 nt-0.14□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YBR064WYBR064W 429 nt-0.14□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 CUL3YGR003W 2235 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 PRP42YDR235W 1635 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YPT6YLR262C 648 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YCL002CYCL002C 792 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 RCO1YMR075W 2055 nt-0.15□□□□□ -2.43
PKR1Q03880 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.16□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YPR039WYPR039W 336 nt-0.16□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.16□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 COG8YML071C 1824 nt-0.16□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 ORC3YLL004W 1851 nt-0.16□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 MRPL32YCR003W 552 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 OLI1Q0130 231 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 PRP21YJL203W 843 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 ILM1YJR118C 612 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YLR198CYLR198C 360 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YPL185WYPL185W 396 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 ASE1YOR058C 2658 nt-0.17□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YGL239CYGL239C 315 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 SLX9YGR081C 633 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 APQ13YJL075C 417 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YOL014WYOL014W 375 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 EFR3YMR212C 2349 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 THO2YNL139C 4794 nt-0.18□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 RPL35AYDL191W 363 nt-0.19□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 OST4YDL232W 111 nt-0.19□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 RPS27AYKL156W 249 nt-0.19□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YOL160WYOL160W 342 nt-0.19□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 snR9snR9 187 nt-0.2□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YDR029WYDR029W 315 nt-0.2□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 SCEIQ0160 708 nt-0.2□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 YMR254CYMR254C 309 nt-0.2□□□□□ -2.44
PKR1Q03880 RAD34YDR314C 2079 nt-0.2□□□□□ -2.44
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