Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 SYH1YPL105C 2550 nt2.53□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 SPC98YNL126W 2541 nt2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 PFD1YJL179W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YOR302WYOR302W 78 nt2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 RTT101YJL047C 2529 nt2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 TFC3YAL001C 3483 nt2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 SAS3YBL052C 2496 nt2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 NAM7YMR080C 2916 nt2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 PUT3YKL015W 2940 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 HSH155YMR288W 2916 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 SRP14YDL092W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YJL182CYJL182C 318 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 IST2YBR086C 2841 nt2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 PET309YLR067C 2898 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 UTP22YGR090W 3714 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 RGA1YOR127W 3024 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 ENV11YGR071C 2583 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YLR294CYLR294C 330 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YNL198CYNL198C 303 nt2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 RPL37BYDR500C 267 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 RPS27BYHR021C 249 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YOR218CYOR218C 420 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YPR092WYPR092W 306 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 MSH5YDL154W 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 ZIP2YGL249W 2115 nt2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 BNI1YNL271C 5862 nt2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 MSC6YOR354C 2079 nt2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 CTR9YOL145C 3234 nt2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q02979 SPO75YLL005C 2607 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 APL2YKL135C 2181 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 ATP7YKL016C 525 nt2.46□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 SAP185YJL098W 3177 nt2.45□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 RAD34YDR314C 2079 nt2.45□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 MLH3YPL164C 2148 nt2.45□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 RPL34BYIL052C 366 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 DNF1YER166W 4716 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 ELG1YOR144C 2376 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 SEC5YDR166C 2916 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 RLM1YPL089C 2031 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 UFD4YKL010C 4452 nt2.44□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 MAD1YGL086W 2250 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 OLI1Q0130 231 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YIR044CYIR044C 186 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 HMI1YOL095C 2121 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.43□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 BUD2YKL092C 3315 nt2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 IRA2YOL081W 9240 nt2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 TRA1YHR099W 11235 nt2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.42□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YKU70YMR284W 1809 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YOR376WYOR376W 369 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 SGF11YPL047W 300 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 STH1YIL126W 4080 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 DGR2YKL121W 2559 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 HER1YOR227W 3741 nt2.41□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 AGC1YPR021C 2709 nt2.4□□□□□ -2.02
GDE1Q02979 YEL014CYEL014C 306 nt2.4□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 MCM10YIL150C 1716 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 BRE1YDL074C 2103 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 PIG1YLR273C 1947 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 IRC8YJL051W 2469 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 YGR151CYGR151C 336 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 YJL120WYJL120W 324 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 MSH6YDR097C 3729 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 IRE1YHR079C 3348 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 CAT2YML042W 2013 nt2.39□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 RPS25BYLR333C 327 nt2.38□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 YBR174CYBR174C 315 nt2.38□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 NOC3YLR002C 1992 nt2.38□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 SEY1YOR165W 2331 nt2.37□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 KOG1YHR186C 4674 nt2.37□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.37□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 SPO21YOL091W 1830 nt2.37□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 CHC1YGL206C 4962 nt2.36□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 snR74snR74 88 nt2.36□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 SAC3YDR159W 3906 nt2.36□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 PTP2YOR208W 2253 nt2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 DGR1YNL130C-A 147 nt2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q02979 CUL3YGR003W 2235 nt2.34□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 SEC63YOR254C 1992 nt2.34□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 GYP5YPL249C 2685 nt2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 FRK1YPL141C 2598 nt2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YDL118WYDL118W 381 nt2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 ECM12YHR021W-A 456 nt2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YLR140WYLR140W 327 nt2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 SEC31YDL195W 3822 nt2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q02979 YLL007CYLL007C 1998 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 119.4 ms