Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms