Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA4Q00056 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms