Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms